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Tu peux aussi concaténer une clé que tu auras défini (n'importe quelle chaine de caractère de n'importe quelle longueur...) avec le timestamp actuel, tu hash en md5 par exemple et coté PHP tu vérifies que le code viens bien de la dernière seconde ou celle d'avant.
Avec ca, si un mec y accède...c'est le plus grand hackeur de l'histoire de l'humanité.

Moi, ce que je ferais, c'est que j'enregistrerais quelque part les accès au fichier. Lorsque le script serait appelé, il vérifierait que la dernière exécution à eu lieu il y a un temps raisonnable (moins que le cron, au cas où ce dernier ait un poil d'avance).
Tu peux aussi vérifier que le nombre d'exécution correspond au nombre d'executions qui aurait du avoir lieu depuis tel instant.